武汉大学的校友会历史悠久，早在武汉大学前身武昌高等师范学校时期，在1916年学校就成立了校友会机构，组织在校师生和毕业校友开展丰富多彩的活动。

在20世纪40年代，上海、南京、武汉、成都等一些大城市也有武大校友会组织。在1947年震惊中外的“六一”惨案中，当时的武大南京校友会、武大上海校友会的校友冒着杀头坐牢的危险，四处奔波，印传单、发照片，打破了国民党反动政府的新闻封锁，戳穿了国民党政府的谎言，使武汉大学的“六一”惨案真相大白于天下，及时得到中共地下党和全国进步人士的有力声援。

党的十一届三中全会之后，武汉大学于1983年11月重新成立了校友会，校友会工作得到了历届校领导的重视和各地校友的热情支持。1995年7月武汉大学校友总会被中华人民共和国民政部批准为合法的社团，武汉水利电力大学校友总会成立于1989年12月，武汉测绘科技大学校友总会成立于1995年2月（经武汉市民政局批准成立）。 四校合并组建新的武汉大学后，成立了新的武汉大学校友总会。在校领导和各地校友的支持下，从2001年4月起，各地也先后合并组建了新的校友会。